中国近代思想史研究室成立于1992年(前身是1988年组建的近代思想史课题组),为学部委员耿云志亲手创立。历任主任为耿云志、闻黎明、郑大华,现任主任邹小站、副主任王波。研究室现有7人,其中研究员2人,副研究员3人,助理研究员2人。自成立以来,研究积极承担国家社科基金以及院所各项课题,已结项的重大集体课题有“近代中国人对民主的认识与实践”(中国社科院重点课题)、“近代中国文化转型研究”(中国社会科学院重大课题)、“中国近代思想通史”(中国社会科学院重大课题)等。据不完全统计,自成立以来,研究室已出版学术专著35部(其中含合著2部),1000多万字;论文集15部(其中含主编4部),700余万字;资料集25种(其中含主编4种),100余册,5000余万字;译著7部(其中含合译4部),近200万字;论文500多篇,600多万字。获院优秀成果奖5项,省部级优秀成果奖4项,所优秀成果奖10项,国家图书奖1项,中国图书奖3项。2002年,中国近代思想史学科列入中国社会科学院第一批重点学科建设工程,以后又陆续开展第二、三、四期重点学科建设。研究室在中国近代思想通史、近代中国文化转型研究、近代中国人对西方民主的认识与实践研究、晚清变革思想研究、民初思想研究、新文化运动研究、中华民族复兴思潮研究、民国乡村建设思想研究、域外思想与近代中国思想研究、近代西化思想与保守思想研究,以及胡适、梁启超、康有为、章太炎、孙中山、章士钊、梁漱溟、张君劢、丁文江等人物研究方面,成果丰硕,为学界所称道,形成了自己的优势领域。在努力做好研究工作的同时,研究室积极联络学界同道,推动中国近代思想史研究向前发展。2004年起,已连续主办七届中国近代思想史国际学术研讨会,分别是2004年的吉首会议,2006年的烟台会议,2010年的洛阳会议,2012年的长沙会议,2014年的西安会议,2016年的长沙会议,2018年的南海会议。2005年成立中国近代思想研究中心,并陆续出版“中国近代思想史研究集刊”(已出11辑,每辑约50万字)。研究室与国内外学界联系广泛,多次邀请海内外多位著名学者到所讲学交流,参与相关学术研讨会。目前承担的主要课题有“中华思想通史晚清时期卷”、“中华思想通史南京临时政府与北洋政府时期卷”、“近代以来民族复兴思想研究”、“中国共产党中华民族观念及内涵演变之研究”等。